Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Dsg1cQ7TSF0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Dsg1cQ7TSF0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms