Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trappc6aQ78XR0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trappc6aQ78XR0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Trappc6aQ78XR0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trappc6aQ78XR0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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