Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim12Q78RX3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms