Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snd1Q78PY7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms