Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tmeff1Q6PFE7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms