Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ss18Q62280 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ss18Q62280 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ss18Q62280 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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