Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gbp4Q61107 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms