Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf15Q5UBV8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms