Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Znf608Q56A10 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf608Q56A10 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms