Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Defa20Q45VN2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Defa20Q45VN2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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