Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
D130052B06RikQ3UW13 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms