Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28047Q3US59 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms