Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Usp30Q3UN04 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp30Q3UN04 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms