Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULZ2

Fhdc1, FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhdc1Q3ULZ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fhdc1Q3ULZ2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms