Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

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Length 105 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q3U595 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q3U595 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q3U595 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q3U595 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U595 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U595 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q3U595 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms