Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sec24aQ3U2P1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sec24aQ3U2P1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms