Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pdlim7Q3TJD7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms