Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nlrp1aQ2LKU9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms