Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm1123Q1RME4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm1123Q1RME4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms