Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Rpusd3Q14AI6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rpusd3Q14AI6 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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