Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms