Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vps8Q0P5W1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms