Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Znf541Q0GGX2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Znf541Q0GGX2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms