Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms