Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnma1Q08460 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms