Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Siah2Q06986 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm37517-201ENSMUST00000194004 1289 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Siah2Q06986 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms