Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Sox13Q04891 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms