Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gbp1Q01514 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms