Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Serpina1cQ00896 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms