Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Apoa1Q00623 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Apoa1Q00623 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms