Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NficP70255 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NficP70255 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NficP70255 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NficP70255 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NficP70255 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NficP70255 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NficP70255 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NficP70255 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NficP70255 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms