Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms