Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usp25P57080 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms