Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn18P56857 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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