Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hoxc13P50207 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms