Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl28P41105 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Rpl28P41105 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
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