Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aco1P28271 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Aco1P28271 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Aco1P28271 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms