Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NdnP25233 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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NdnP25233 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
NdnP25233 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NdnP25233 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NdnP25233 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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NdnP25233 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
NdnP25233 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
NdnP25233 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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