Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnnc2P20801 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms