Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NelfeP19426 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms