Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Defa1P11477 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Defa1P11477 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms