Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pax1P09084 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms