Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
H2-Ab1P01921 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms