Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cbx4O55187 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cbx4O55187 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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