Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SlkO54988 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SlkO54988 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SlkO54988 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SlkO54988 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms