Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Prrt1O35449 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms