Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cnih1O35372 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Cnih1O35372 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cnih1O35372 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cnih1O35372 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cnih1O35372 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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Cnih1O35372 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cnih1O35372 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms