Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dgcr6O35347 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms