Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casq1O09165 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casq1O09165 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Casq1O09165 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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