Protein–RNA interactions for Protein: O09108

Lhb, Lutropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LhbO09108 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
LhbO09108 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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LhbO09108 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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LhbO09108 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
LhbO09108 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LhbO09108 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LhbO09108 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
LhbO09108 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
LhbO09108 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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LhbO09108 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LhbO09108 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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LhbO09108 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
LhbO09108 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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